寧衛(wèi)健疾控〔2021〕308號(hào)
各縣區(qū)衛(wèi)健局,西寧市疾病預(yù)防控制中心:
??? 現(xiàn)將《西寧市致病菌識(shí)別網(wǎng)監(jiān)測(cè)方案》印發(fā)給你們,請(qǐng)各地區(qū)、各單位遵照?qǐng)?zhí)行。
西寧市衛(wèi)生健康委員會(huì)
2021年6月25日
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(信息公開(kāi)形式:主動(dòng)公開(kāi))
西寧市致病菌識(shí)別網(wǎng)監(jiān)測(cè)方案
為規(guī)范、有序開(kāi)展基于國(guó)家致病菌識(shí)別網(wǎng)的細(xì)菌性傳染病監(jiān)測(cè)和持續(xù)建設(shè)工作,全面提高我市細(xì)菌性傳染病病原學(xué)監(jiān)測(cè)工作質(zhì)量和水平,加強(qiáng)網(wǎng)絡(luò)實(shí)驗(yàn)室能力建設(shè),結(jié)合我市實(shí)際情況,特制定本方案。
一、監(jiān)測(cè)目的
加強(qiáng)疾控系統(tǒng)病原檢測(cè)鑒定和分析能力,開(kāi)展系統(tǒng)化的實(shí)驗(yàn)室監(jiān)測(cè)和分析,掌握病原特征和流行態(tài)勢(shì),提升暴發(fā)疫情預(yù)警和應(yīng)急處置中“一錘定音”能力,為細(xì)菌性傳染病疫情分析和防控決策提供科學(xué)依據(jù)。
二、監(jiān)測(cè)內(nèi)容和工作要求
(一)針對(duì)重要的細(xì)菌性傳染病,開(kāi)展標(biāo)本采集、分離鑒定和實(shí)驗(yàn)室分析,獲得連續(xù)性病原學(xué)監(jiān)測(cè)數(shù)據(jù)。
1.監(jiān)測(cè)范圍
(1)法定傳染病種及其病原菌
①腸道傳染病病原菌:霍亂弧菌、傷寒和副傷寒沙門(mén)菌、志賀菌、其他感染性腹瀉病原菌(非傷寒沙門(mén)菌、產(chǎn)腸毒素及志賀類(lèi)毒素的大腸埃希菌、空腸彎曲菌、副溶血弧菌、小腸結(jié)腸炎耶爾森菌等)。
②呼吸道傳染病病原菌:腦膜炎奈瑟菌、A組溶血性鏈球菌(猩紅熱)等。
③自然疫源性傳染病病原菌:炭疽芽胞桿菌等。
(2)各地區(qū)根據(jù)本地流行和新發(fā)傳染病實(shí)際情況,擴(kuò)展的其他致病菌,以及其他引起公共衛(wèi)生問(wèn)題的致病菌,例如軍團(tuán)菌、萊姆病螺旋體、鉤端螺旋體、豬鏈球菌、類(lèi)鼻疽伯克霍爾德菌、單增李斯特菌等。
2.監(jiān)測(cè)時(shí)間和方式
(1)常規(guī)監(jiān)測(cè):針對(duì)監(jiān)測(cè)的傳染病,西寧市參比實(shí)驗(yàn)室根據(jù)本市實(shí)際情況,開(kāi)展常規(guī)監(jiān)測(cè),設(shè)置監(jiān)測(cè)哨點(diǎn),采集標(biāo)本,按要求開(kāi)展病原學(xué)分析,積累和獲取連續(xù)性監(jiān)測(cè)數(shù)據(jù)。該項(xiàng)工作納入疾控系統(tǒng)日常工作,全年開(kāi)展。
(2)專(zhuān)題監(jiān)測(cè):國(guó)家中心實(shí)驗(yàn)室根據(jù)上一年監(jiān)測(cè)情況或當(dāng)年新發(fā)突發(fā)傳染病的情況,布置專(zhuān)題監(jiān)測(cè)任務(wù),發(fā)布監(jiān)測(cè)實(shí)施方案,遴選網(wǎng)絡(luò)實(shí)驗(yàn)室和哨點(diǎn),針對(duì)特定致病菌開(kāi)展專(zhuān)題實(shí)驗(yàn)室監(jiān)測(cè),獲得代表性監(jiān)測(cè)數(shù)據(jù)。該項(xiàng)工作進(jìn)行專(zhuān)題設(shè)計(jì),部分區(qū)域定期開(kāi)展。
3.監(jiān)測(cè)點(diǎn)設(shè)置
根據(jù)《關(guān)于加強(qiáng)公共衛(wèi)生體系建設(shè)和重大疫情防控救治體系建設(shè)工作的通知》以及《國(guó)家致病菌識(shí)別網(wǎng)監(jiān)測(cè)和能力建設(shè)方案》選定西寧市疾控中心為區(qū)域參比實(shí)驗(yàn)室。醫(yī)療機(jī)構(gòu)/疾控中心選定西寧市第一人民醫(yī)院、西寧市第二人民醫(yī)院、西寧市第三人民醫(yī)院、湟中區(qū)第一人民醫(yī)院、大通縣醫(yī)院作為監(jiān)測(cè)哨點(diǎn)醫(yī)院。疾控中心選定城西區(qū)疾控中心、城東區(qū)疾控中心、城中區(qū)疾控中心、城北區(qū)疾控中心、湟源縣疾控中心、湟中區(qū)疾控中心、大通縣疾控中心為監(jiān)測(cè)點(diǎn),按要求開(kāi)展致病菌識(shí)別網(wǎng)監(jiān)測(cè)工作(見(jiàn)附表1)。
附表1
致病菌識(shí)別網(wǎng)細(xì)菌性傳染病監(jiān)測(cè)哨點(diǎn)醫(yī)院/疾控中心
哨點(diǎn)醫(yī)院名稱(chēng)
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疾控中心收集和轉(zhuǎn)運(yùn)
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份?數(shù)
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腸道傳染病標(biāo)本
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呼吸道傳染病標(biāo)本
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西寧市第一人民醫(yī)院
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城中區(qū)疾控中心
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300
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180
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120
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西寧市第二人民醫(yī)院
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城北區(qū)疾控中心
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300
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180
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120
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西寧市第三人民醫(yī)院
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城北區(qū)疾控中心
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200
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120
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80
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湟中區(qū)醫(yī)院
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湟中區(qū)疾控中心
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100
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?60
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40
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大通縣醫(yī)院
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大通縣疾控中心
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100
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?60
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40
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??5.標(biāo)本采集、菌株分離培養(yǎng)和收集
(1)標(biāo)本采集和致病菌分離培養(yǎng):
監(jiān)測(cè)哨點(diǎn)醫(yī)院每年完成標(biāo)本采集1000份,其中腸道傳染病標(biāo)本不得少于600份、呼吸道傳染病標(biāo)本不得少于400份,標(biāo)本總數(shù)不得少于1000份,詳細(xì)要求如下:
①腸道傳染病標(biāo)本(不少于600份):
采集每日腹瀉三次及以上、并伴糞便性狀改變的門(mén)診就診病例急性期糞便標(biāo)本,進(jìn)行致病菌分離培養(yǎng)。致病菌種類(lèi)根據(jù)轄區(qū)內(nèi)往年分離情況自行選擇,不得少于3種,且在制定年度工作任務(wù)后可在年中增加菌種種類(lèi),但不能減少。
②呼吸道傳染病標(biāo)本(不少于400份):
采集表現(xiàn)咽痛、粟粒樣皮疹、楊梅舌、伴或不伴發(fā)熱的就診病例咽拭子標(biāo)本,進(jìn)行A組溶血性鏈球菌的分離鑒定(猩紅熱病例),腦膜炎奈瑟菌等呼吸道傳染病標(biāo)本進(jìn)行致病菌分離培養(yǎng)。
③采集炭疽芽胞桿菌等人獸共患傳染病標(biāo)本進(jìn)行致病菌分離培養(yǎng)。
(2)菌株收集
監(jiān)測(cè)哨點(diǎn)醫(yī)院菌株收集來(lái)源包括:
上述腸道傳染病、呼吸道傳染病、人獸共患病標(biāo)本采集后分離的病原菌。
各哨點(diǎn)醫(yī)院和監(jiān)測(cè)點(diǎn)分離的傳染病相關(guān)致病菌在2個(gè)工作日內(nèi)上送至市疾控參比實(shí)驗(yàn)室,具體包括:霍亂弧菌、炭疽芽胞桿菌、傷寒副傷寒沙門(mén)菌、志賀菌、O157:H7大腸埃希菌、萊姆病螺旋體、鉤端螺旋體、豬鏈球菌、類(lèi)鼻疽伯克霍爾德菌、單增李斯特菌、鳥(niǎo)-胞內(nèi)分枝桿菌復(fù)合群。
突發(fā)傳染病疫情調(diào)查涉及的致病菌。
(3)陽(yáng)性菌株的保存
??各哨點(diǎn)醫(yī)院和區(qū)縣疾控中心實(shí)驗(yàn)室培養(yǎng)的傳染病相關(guān)致病菌菌株應(yīng)接種到磁珠凍存管保存(可保存在-20℃冰箱)或軟瓊脂培養(yǎng)基(軟瓊脂培養(yǎng)基應(yīng)盡快送檢),軟瓊脂培養(yǎng)基需培養(yǎng)18—24小時(shí)后,保存在2℃—8℃冰箱中。
6.標(biāo)本(菌株)轉(zhuǎn)運(yùn)
各轄區(qū)內(nèi)所有臨床醫(yī)療機(jī)構(gòu)實(shí)驗(yàn)室分離的傳染病相關(guān)致病菌在2個(gè)工作日內(nèi)由區(qū)縣疾病預(yù)防控制中心收集送至區(qū)域參比實(shí)驗(yàn)室(西寧市疾控中心),標(biāo)本送檢應(yīng)當(dāng)按照《中華人民共和國(guó)傳染病防治法》、《病原微生物實(shí)驗(yàn)室生物安全管理?xiàng)l例》、《可感染人類(lèi)的高致病性病原微生物菌(毒)種或樣本運(yùn)輸管理規(guī)定》和《人間傳染的病原微生物菌(毒)種保藏機(jī)構(gòu)管理辦法》相關(guān)要求進(jìn)行。
7.西寧市疾控參比實(shí)驗(yàn)室分析和結(jié)果填報(bào)
完成菌株鑒定、分子分型、耐藥檢測(cè)、全基因組測(cè)序等實(shí)驗(yàn)室分析工作。
(1)市參比實(shí)驗(yàn)室負(fù)責(zé)復(fù)核哨點(diǎn)醫(yī)院和/或區(qū)縣級(jí)疾控采集和運(yùn)送的標(biāo)本(菌株),并及時(shí)進(jìn)行菌株分離培養(yǎng)鑒定、基本病原學(xué)特征分析和進(jìn)行目標(biāo)菌分離鑒定和血清型/生物型/生化型的實(shí)驗(yàn)分析,按照不同病原菌的常規(guī)培養(yǎng)鑒定方法進(jìn)行。分離培養(yǎng)鑒定工作在接受標(biāo)本(菌株)后立即開(kāi)展(標(biāo)本儲(chǔ)藏會(huì)影響分離率)。
(2)耐藥性檢測(cè)
每年完成至少100株致病菌的耐藥性檢測(cè)。開(kāi)展耐藥性檢測(cè)的菌種類(lèi)型包括:霍亂弧菌、沙門(mén)菌、志賀菌、大腸埃希菌、彎曲菌、副溶血弧菌、腦膜炎奈瑟菌等。?
(3)分子分型分析
每年完成至少100株致病菌的分子分型。不同病原細(xì)菌種或型,采用不同的分子分型方法,主要包括脈沖場(chǎng)凝膠電泳(PFGE)、多位點(diǎn)可變數(shù)目串聯(lián)重復(fù)序列分析(MLVA)、多位點(diǎn)序列分型(MLST)等,參比實(shí)驗(yàn)室按照國(guó)家致病菌識(shí)別網(wǎng)標(biāo)準(zhǔn)操作規(guī)程開(kāi)展致病菌分子分型實(shí)驗(yàn)和分析。分子分型分析需在獲得菌株后2周內(nèi)完成并在“國(guó)家致病菌識(shí)別網(wǎng)實(shí)驗(yàn)室監(jiān)測(cè)信息系統(tǒng)”中填報(bào)數(shù)據(jù)。
(4)全基因組測(cè)序
參比實(shí)驗(yàn)室每年完成至少100株致病菌的全基因組測(cè)序(沒(méi)有能力的單位將菌株送至省疾控中心進(jìn)行測(cè)序)。完成菌株的全基因組序列框架圖測(cè)定,測(cè)序分析需在獲得菌株后3個(gè)月內(nèi)完成并在“國(guó)家致病菌識(shí)別網(wǎng)實(shí)驗(yàn)室監(jiān)測(cè)信息系統(tǒng)”中填報(bào)數(shù)據(jù)。
(5)結(jié)果填報(bào)
按照國(guó)家致病菌識(shí)別網(wǎng)信息管理要求,及時(shí)準(zhǔn)確填報(bào)“國(guó)家致病菌識(shí)別網(wǎng)實(shí)驗(yàn)室監(jiān)測(cè)信息系統(tǒng)”。
8.省級(jí)中心實(shí)驗(yàn)室
(1)收集并保藏本省致病菌識(shí)別網(wǎng)監(jiān)測(cè)陽(yáng)性菌株,每省全年收集保存不少于平均每地市50株陽(yáng)性菌株。
(2)完成市州級(jí)網(wǎng)絡(luò)實(shí)驗(yàn)室陽(yáng)性菌株的抽樣復(fù)核工作,包括復(fù)核鑒定、耐藥性檢測(cè)、分子分型、全基因組測(cè)序,所有復(fù)核任務(wù)均勻至每季度進(jìn)行。
(3)數(shù)據(jù)審核
按照國(guó)家致病菌識(shí)別網(wǎng)信息管理要求,審核轄區(qū)內(nèi)地市級(jí)網(wǎng)絡(luò)實(shí)驗(yàn)室填報(bào)“國(guó)家致病菌識(shí)別網(wǎng)實(shí)驗(yàn)室監(jiān)測(cè)信息系統(tǒng)”和分析結(jié)果的完整性、準(zhǔn)確性。
(4)負(fù)責(zé)實(shí)驗(yàn)室分析技術(shù)現(xiàn)場(chǎng)指導(dǎo)、協(xié)助提高各實(shí)驗(yàn)室技術(shù)能力,省級(jí)室間實(shí)驗(yàn)室質(zhì)量控制考核工作。
(5)組織對(duì)網(wǎng)絡(luò)實(shí)驗(yàn)室的質(zhì)控考核工作。
(二)針對(duì)細(xì)菌性傳染病暴發(fā)疫情,應(yīng)用實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)監(jiān)測(cè)技術(shù)提供系統(tǒng)化支持,快速識(shí)別病原,追蹤溯源。
1.原則
實(shí)驗(yàn)室工作人員與流行病學(xué)和現(xiàn)場(chǎng)人員協(xié)作,積極參與疫情調(diào)查處置,共同完成采集標(biāo)本、記錄疫情相關(guān)信息,實(shí)時(shí)開(kāi)展致病菌的實(shí)驗(yàn)室分析,發(fā)揮“一錘定音”的作用,快速識(shí)別病原菌,獲取病原菌特征,共享所有實(shí)驗(yàn)室分析結(jié)果,開(kāi)展疫情分析討論,發(fā)現(xiàn)和發(fā)生發(fā)展規(guī)律,及時(shí)阻斷傳播路徑,追蹤傳染來(lái)源,防止疫情發(fā)展和蔓延。
2.事件類(lèi)型
(1)在實(shí)驗(yàn)室監(jiān)測(cè)工作中,短時(shí)期內(nèi)(定義為1個(gè)月)出現(xiàn)致病菌的分子分型或基因組特征相近的病例數(shù)量超過(guò)3個(gè)或以上,定義為分子分型預(yù)警事件,開(kāi)展追蹤溯源調(diào)查。
(2)流行病學(xué)定義的細(xì)菌性傳染病暴發(fā)疫情,提供系統(tǒng)化實(shí)驗(yàn)室支持。
3.標(biāo)本采集與運(yùn)送
由疫情發(fā)生地的疾控中心組織疫情標(biāo)本的采集和運(yùn)送,包括醫(yī)療機(jī)構(gòu)中的病例標(biāo)本采集、傳播可能因素調(diào)查中采集的標(biāo)本,運(yùn)送至西寧市疾控中心參比實(shí)驗(yàn)室或省級(jí)實(shí)驗(yàn)室。
4.實(shí)驗(yàn)室分析
由西寧市參比實(shí)驗(yàn)室或省級(jí)實(shí)驗(yàn)室完成病原細(xì)菌分離鑒定、耐藥檢測(cè)和分子分型以及全基因組測(cè)序分析。其中病原細(xì)菌分離培養(yǎng)鑒定按照不同病原菌的常規(guī)培養(yǎng)鑒定方法進(jìn)行,耐藥檢測(cè)和分子分型以及全基因組測(cè)序分析按照《國(guó)家致病菌識(shí)別網(wǎng)實(shí)驗(yàn)室技術(shù)手冊(cè)》開(kāi)展,及時(shí)完成。
5.結(jié)果報(bào)送
(1)?實(shí)驗(yàn)室分析結(jié)果與流行病學(xué)人員共享,開(kāi)展疫情分析討論。
(2)實(shí)驗(yàn)室分析結(jié)果按要求填報(bào)國(guó)家致病菌識(shí)別網(wǎng)信息系統(tǒng)。
(3)參比實(shí)驗(yàn)室以專(zhuān)題報(bào)告方式上報(bào)省疾控中心實(shí)驗(yàn)室及國(guó)家中心實(shí)驗(yàn)室。
三、組織管理與職責(zé)分工
國(guó)家致病菌識(shí)別網(wǎng)由各級(jí)衛(wèi)生行政部門(mén)和業(yè)務(wù)實(shí)施單位組成。業(yè)務(wù)實(shí)施單位由各級(jí)疾控中心和網(wǎng)底機(jī)構(gòu)組成。按照統(tǒng)一部署、分級(jí)管理、分類(lèi)指導(dǎo)的原則,科學(xué)有序的開(kāi)展細(xì)菌性傳染病監(jiān)測(cè)工作。
(一)衛(wèi)生行政部門(mén)?
國(guó)家衛(wèi)健委負(fù)責(zé)管理國(guó)家致病菌識(shí)別網(wǎng)的建設(shè)和運(yùn)行,組織編制和發(fā)布監(jiān)測(cè)工作指導(dǎo)方案,定期組織督導(dǎo)考核,通報(bào)國(guó)家致病菌識(shí)別網(wǎng)監(jiān)測(cè)工作進(jìn)展。
省級(jí)、市級(jí)、區(qū)縣級(jí)衛(wèi)生計(jì)生行政部門(mén)負(fù)責(zé)組織、協(xié)調(diào)、督導(dǎo)和評(píng)估本轄區(qū)的識(shí)別網(wǎng)監(jiān)測(cè)工作,為識(shí)別網(wǎng)工作提供必需的政策和經(jīng)費(fèi)支持。組織編制和發(fā)布轄區(qū)致病菌識(shí)別網(wǎng)監(jiān)測(cè)工作方案。每年定期組織對(duì)本轄區(qū)識(shí)別網(wǎng)的先進(jìn)單位和先進(jìn)個(gè)人進(jìn)行表彰。
(二)中國(guó)疾病預(yù)防控制中心
1.負(fù)責(zé)國(guó)家致病菌識(shí)別網(wǎng)監(jiān)測(cè)工作的具體組織和協(xié)調(diào),制定監(jiān)測(cè)工作相關(guān)技術(shù)文件;負(fù)責(zé)全國(guó)監(jiān)測(cè)工作的技術(shù)培訓(xùn)和指導(dǎo),開(kāi)展國(guó)家致病菌識(shí)別網(wǎng)的督導(dǎo)、考核和評(píng)估工作;組織和實(shí)施對(duì)省級(jí)網(wǎng)絡(luò)實(shí)驗(yàn)室的評(píng)估工作。
2.負(fù)責(zé)建立國(guó)家致病菌識(shí)別網(wǎng)質(zhì)量控制體系,組織對(duì)省級(jí)網(wǎng)絡(luò)實(shí)驗(yàn)室的質(zhì)控考核工作。
3.負(fù)責(zé)對(duì)暴發(fā)疫情處置的實(shí)驗(yàn)室分析和指導(dǎo),對(duì)各省級(jí)中心實(shí)驗(yàn)室上送的特殊標(biāo)本和菌株進(jìn)行復(fù)核鑒定。
4.負(fù)責(zé)建設(shè)、運(yùn)行和維護(hù)信息管理系統(tǒng),強(qiáng)化信息安全。
5.定期分析和反饋全國(guó)監(jiān)測(cè)數(shù)據(jù),編發(fā)全國(guó)網(wǎng)絡(luò)監(jiān)測(cè)月報(bào)。
(三)省級(jí)疾病預(yù)防控制中心
1.負(fù)責(zé)本省識(shí)別網(wǎng)監(jiān)測(cè)工作的具體組織實(shí)施和協(xié)調(diào),開(kāi)展識(shí)別網(wǎng)實(shí)驗(yàn)室監(jiān)測(cè)工作,開(kāi)展相關(guān)技術(shù)培訓(xùn)和指導(dǎo);負(fù)責(zé)本省致病菌識(shí)別網(wǎng)監(jiān)測(cè)工作的督導(dǎo)、考核和評(píng)估工作。
2.負(fù)責(zé)開(kāi)展和實(shí)施質(zhì)量控制工作,組織對(duì)本省地市級(jí)網(wǎng)絡(luò)實(shí)驗(yàn)室的質(zhì)控考核工作。?
3.負(fù)責(zé)本省暴發(fā)疫情處置的實(shí)驗(yàn)室分析和指導(dǎo);負(fù)責(zé)本省內(nèi)地市級(jí)網(wǎng)絡(luò)實(shí)驗(yàn)室陽(yáng)性菌株的收集、符合鑒定和結(jié)果反饋。
4.按照要求上送特殊標(biāo)本和陽(yáng)性菌株至國(guó)家中心實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行復(fù)核。
5.每月對(duì)本省識(shí)別網(wǎng)監(jiān)測(cè)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析和反饋,并以月報(bào)形式報(bào)送省級(jí)衛(wèi)生行政部門(mén),同時(shí)報(bào)送國(guó)家中心實(shí)驗(yàn)室(電子郵箱:chinapin@icdc.cn)。
(四)市級(jí)疾病預(yù)防控制中心
1.負(fù)責(zé)本地市識(shí)別網(wǎng)監(jiān)測(cè)工作的具體組織、實(shí)施和協(xié)調(diào),分配足額從事識(shí)別網(wǎng)工作的人員;開(kāi)展識(shí)別網(wǎng)實(shí)驗(yàn)室監(jiān)測(cè)工作,負(fù)責(zé)本地市網(wǎng)底機(jī)構(gòu)細(xì)菌性傳染病監(jiān)測(cè)和暴發(fā)處置的實(shí)驗(yàn)室技術(shù)培訓(xùn)和指導(dǎo)。
2.開(kāi)展標(biāo)本和菌株分離,鑒定轄區(qū)網(wǎng)底機(jī)構(gòu)上送的菌株,按監(jiān)測(cè)工作要求開(kāi)展實(shí)驗(yàn)室分析工作,及時(shí)填報(bào)反饋結(jié)果。
3.按要求上送陽(yáng)性菌株至省級(jí)疾控中心進(jìn)行復(fù)核。
4.每月對(duì)本地市識(shí)別網(wǎng)監(jiān)測(cè)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析和反饋,以月報(bào)形式報(bào)送地市級(jí)衛(wèi)生行政部門(mén),并報(bào)上級(jí)疾控中心。
(五)網(wǎng)底機(jī)構(gòu)
?1.縣區(qū)級(jí)疾控中心
(1)縣區(qū)級(jí)疾控中心負(fù)責(zé)收集和轉(zhuǎn)運(yùn)哨點(diǎn)醫(yī)院采集的相關(guān)生物標(biāo)本和陽(yáng)性菌株至上級(jí)疾控中心。
(2)獲取基本流行病學(xué)信息,核實(shí)信息完整性,報(bào)送信息數(shù)據(jù)至上級(jí)疾控中心(見(jiàn)附表2.3)。
(3)協(xié)助上級(jí)疾控中心開(kāi)展轄區(qū)傳染病暴發(fā)疫情的調(diào)查處置。
2.哨點(diǎn)醫(yī)療機(jī)構(gòu)
(1)指定專(zhuān)門(mén)科室和人員負(fù)責(zé)致病菌識(shí)別網(wǎng)監(jiān)測(cè)工作。
(2)按照監(jiān)測(cè)方案要求,做好生物標(biāo)本采集與保存工作。
(3)按照監(jiān)測(cè)方案要求,充分利用醫(yī)院HIS系統(tǒng),做好標(biāo)本相關(guān)信息登記工作(見(jiàn)附表2.3)。
(4)發(fā)生傳染病暴發(fā)疫情時(shí),協(xié)助完成相關(guān)的病例調(diào)查工作。
(5)接受轄區(qū)疾控中心在識(shí)別網(wǎng)監(jiān)測(cè)工作方面的技術(shù)指導(dǎo)和培訓(xùn),接受衛(wèi)生行政機(jī)構(gòu)的督導(dǎo)、考核和評(píng)估。
四、生物安全要求
監(jiān)測(cè)工作過(guò)程中,有關(guān)標(biāo)本和菌株的采集、轉(zhuǎn)運(yùn)、保藏及實(shí)驗(yàn)室分析等各項(xiàng)活動(dòng)均應(yīng)遵守國(guó)家相應(yīng)生物安全管理規(guī)定。
五、信息安全和管理
(一)國(guó)家致病菌識(shí)別網(wǎng)信息系統(tǒng)管理
各網(wǎng)絡(luò)實(shí)驗(yàn)室(疾病預(yù)防控制中心)的賬號(hào)由系統(tǒng)管理員建立和維護(hù),系統(tǒng)權(quán)限由業(yè)務(wù)管理員設(shè)置。
(二)網(wǎng)絡(luò)信息安全
各網(wǎng)絡(luò)成員單位要按照國(guó)家相關(guān)信息安全法規(guī)和本機(jī)構(gòu)信息安全管理規(guī)定,管理和保障致病菌識(shí)別網(wǎng)的信息安全。?
六、培訓(xùn)、考核和督導(dǎo)
(一)培訓(xùn)
省級(jí)中心實(shí)驗(yàn)室每年組織對(duì)本省份的網(wǎng)絡(luò)實(shí)驗(yàn)室人員的培訓(xùn),區(qū)域參比實(shí)驗(yàn)室協(xié)助完成本省的技術(shù)培訓(xùn)。各網(wǎng)絡(luò)實(shí)驗(yàn)室可選派專(zhuān)業(yè)技術(shù)人員至省級(jí)中心實(shí)驗(yàn)室或國(guó)家中心實(shí)驗(yàn)室進(jìn)修。
根據(jù)致病菌識(shí)別網(wǎng)工作需求,國(guó)家中心實(shí)驗(yàn)室和省級(jí)中心實(shí)驗(yàn)室可派出專(zhuān)家對(duì)部分網(wǎng)絡(luò)實(shí)驗(yàn)室所在疾病預(yù)防控制中心技術(shù)人員進(jìn)行現(xiàn)場(chǎng)培訓(xùn)和指導(dǎo)。
(二)技術(shù)考核和工作評(píng)估
1.技術(shù)考核
(1)組織形式
考核分為國(guó)家級(jí)考核和省級(jí)考核。
國(guó)家級(jí)考核由國(guó)家疾控中心組織開(kāi)展省級(jí)中心實(shí)驗(yàn)室及轄區(qū)內(nèi)網(wǎng)絡(luò)實(shí)驗(yàn)室參加的網(wǎng)絡(luò)工作考核。
省級(jí)考核由省級(jí)疾控中心組織開(kāi)展轄區(qū)內(nèi)網(wǎng)絡(luò)實(shí)驗(yàn)室參加的網(wǎng)絡(luò)工作考核。
國(guó)家級(jí)考核每年執(zhí)行一次,在次年年初進(jìn)行。省級(jí)考核應(yīng)在國(guó)家級(jí)考核之前進(jìn)行。
(2)考核內(nèi)容
①盲樣考核:省級(jí)中心實(shí)驗(yàn)室負(fù)責(zé)組織本省市州級(jí)網(wǎng)絡(luò)實(shí)驗(yàn)室的盲樣考核。國(guó)家中心實(shí)驗(yàn)室向省級(jí)網(wǎng)絡(luò)實(shí)驗(yàn)室分發(fā)菌株和樣品,開(kāi)展盲樣考核,內(nèi)容包括細(xì)菌鑒定、耐藥性檢測(cè)和分子分型以及實(shí)驗(yàn)結(jié)果反饋及時(shí)性、信息網(wǎng)絡(luò)傳輸及時(shí)性等方面
②任務(wù)考核:及時(shí)準(zhǔn)確完成內(nèi)容與工作要求中的監(jiān)測(cè)分析任務(wù)規(guī)定的菌株數(shù)量要求,完成率達(dá)到100%;菌株鑒定、耐藥檢測(cè)和分子分型等實(shí)驗(yàn)均在規(guī)定時(shí)間內(nèi)完成,時(shí)效率大于90%;信息記錄完整,均提交識(shí)別網(wǎng)中心數(shù)據(jù)庫(kù),完整率達(dá)到大于90%。
2.工作評(píng)估
省級(jí)疾控中心參照國(guó)家評(píng)估方案,制訂本省份的考評(píng)估案。每年組織對(duì)網(wǎng)絡(luò)實(shí)驗(yàn)室所在的地市或縣區(qū)級(jí)疾病預(yù)防控制中心、哨點(diǎn)醫(yī)院的工作進(jìn)行評(píng)估,并將結(jié)果報(bào)送省級(jí)衛(wèi)生行政部門(mén),由省級(jí)衛(wèi)生行政部門(mén)通報(bào)各市級(jí)衛(wèi)生行政部門(mén)。???
(三)督導(dǎo)
1.省級(jí)督導(dǎo)
省級(jí)衛(wèi)生行政部門(mén)每年組織對(duì)本轄區(qū)部分網(wǎng)絡(luò)實(shí)驗(yàn)室及哨點(diǎn)醫(yī)院進(jìn)行督導(dǎo)檢查,及時(shí)發(fā)現(xiàn)問(wèn)題,提出解決方案,并將督導(dǎo)報(bào)告上報(bào)國(guó)家衛(wèi)生健康委及中國(guó)疾病預(yù)防控制中心備案。
2.市州級(jí)督導(dǎo)
市州級(jí)衛(wèi)生行政部門(mén)負(fù)責(zé)本轄區(qū)區(qū)縣級(jí)實(shí)驗(yàn)室及哨點(diǎn)醫(yī)院的日常督導(dǎo),每年督導(dǎo)2次或以上。
附表2
國(guó)家致病菌識(shí)別網(wǎng)-病原菌樣本信息登記表
一、?樣本信息
1.1樣本編號(hào)*:??????????
1.2采樣時(shí)間*:??????????
1.3樣本來(lái)源地*:??省??市??縣??
1.4樣本歸類(lèi)*:□人;?(若樣本歸類(lèi)為人,請(qǐng)?zhí)顚?xiě)1.5)???□?動(dòng)物;?(若樣本歸類(lèi)為動(dòng)物,請(qǐng)?zhí)顚?xiě)1.6)??
□食品;?(若樣本歸類(lèi)為動(dòng)物,請(qǐng)?zhí)顚?xiě)1.7)?R?環(huán)境(若樣本歸類(lèi)為環(huán)境,請(qǐng)?zhí)顚?xiě)1.8)??
□其他?(若樣本歸類(lèi)為動(dòng)物,請(qǐng)?zhí)顚?xiě)1.9)
1.5?樣本來(lái)源:?□病人;?□健康人;?□攜帶人
樣本名稱(chēng)*:□滲漏液:???□前列腺分泌物;??□肌腱膿液;??□纖支鏡吸痰;?
□氣管內(nèi)痰;??□臍部分泌物;???□大腿穿刺液
患者姓名:??????????(聯(lián)系人姓名:???????????)
性別*:?男????女
民族:?????????????????
病歷號(hào):????????????????
身份證號(hào)碼:??????????????
監(jiān)測(cè)類(lèi)型*:??腹瀉相關(guān);?????呼吸道相關(guān)-百日咳;????呼吸道相關(guān)-猩紅熱;?????
?呼吸道相關(guān)-其他;??自然疫源相關(guān);??????暴發(fā)監(jiān)測(cè)
??分離狀態(tài)*:??分離成功;???分離失?。???未分離;????鸚鵡熱源衣原體陽(yáng)性
1.6樣本來(lái)源*:??家禽;???家畜;???野生動(dòng)物
??樣本名稱(chēng)*:??????
來(lái)源詳情:???????
監(jiān)測(cè)類(lèi)型*:??皮毛;????肉;????臟器;????其他??????
分離狀態(tài)*:??分離成功;??分離失??;?未分離;???鸚鵡熱源衣原體陽(yáng)性
1.7樣本來(lái)源*:??食品加工品;?食用油、油脂及其他制品;?肉制品;
?乳制品;???其他???????
樣本名稱(chēng)*:???????
來(lái)源詳情:???????
監(jiān)測(cè)類(lèi)型*:??腹瀉相關(guān);?????呼吸道相關(guān)-百日咳;????呼吸道相關(guān)-猩紅熱;?????
?呼吸道相關(guān)-其他;??自然疫源相關(guān);??????暴發(fā)監(jiān)測(cè)
分離狀態(tài)*:??分離成功;???分離失??;???未分離;????鸚鵡熱源衣原體陽(yáng)性
1.8樣本來(lái)源*:??考核樣:????質(zhì)控菌株;???土壤;?????水;
??其他????????
樣本名稱(chēng)*:??????
來(lái)源詳情:???????
監(jiān)測(cè)類(lèi)型*:??腹瀉相關(guān);?????呼吸道相關(guān)-百日咳;????呼吸道相關(guān)-猩紅熱;?????
?呼吸道相關(guān)-其他;??自然疫源相關(guān);??????暴發(fā)監(jiān)測(cè)
??分離狀態(tài)*:??分離成功;???分離失?。???未分離;????鸚鵡熱源衣原體陽(yáng)性
1.9監(jiān)測(cè)類(lèi)型*:??腹瀉相關(guān);?????呼吸道相關(guān)-百日咳;????呼吸道相關(guān)-猩紅熱;?????
?呼吸道相關(guān)-其他;??自然疫源相關(guān);??????暴發(fā)監(jiān)測(cè)
??分離狀態(tài)*:??分離成功;???分離失??;???未分離;????鸚鵡熱源衣原體陽(yáng)性
附表3
國(guó)家致病菌識(shí)別網(wǎng)-病原菌菌株信息登記表
一、?樣本信息
1.1樣本編號(hào)*:??????????
1.2采樣時(shí)間*:??????????
1.3樣本來(lái)源地*:??省??市??縣??
1.4樣本歸類(lèi)*:□人;?(若樣本歸類(lèi)為人,請(qǐng)?zhí)顚?xiě)1.5)???□?動(dòng)物;?(若樣本歸類(lèi)為動(dòng)物,請(qǐng)?zhí)顚?xiě)1.6)??
□食品;?(若樣本歸類(lèi)為動(dòng)物,請(qǐng)?zhí)顚?xiě)1.7)?R?環(huán)境(若樣本歸類(lèi)為環(huán)境,請(qǐng)?zhí)顚?xiě)1.8)??
1.5?樣本來(lái)源:?□病人;?□健康人;?□攜帶人
樣本名稱(chēng)*:□滲漏液:???□前列腺分泌物;??□肌腱膿液;??□纖支鏡吸痰;?
□氣管內(nèi)痰;??□臍部分泌物;???□大腿穿刺液
1.6樣本名稱(chēng)*:??????
樣本來(lái)源*:??家禽;???家畜;???野生動(dòng)物
??監(jiān)測(cè)類(lèi)型*:??皮毛;????肉;????臟器;????其他??????
1.7樣本名稱(chēng)*:???????
樣本來(lái)源*:??食品加工品;?食用油、油脂及其他制品;?肉制品;
?乳制品;???其他???????
1.8樣本名稱(chēng)*:??????
樣本來(lái)源*:??考核樣:???質(zhì)控菌株;???土壤;?????水;
??其他????????
二、?菌株信息
1.1菌株種類(lèi)*:????????
1.2菌株編號(hào)*:????????
1.3提交時(shí)間*:????????
1.4是否完成指紋圖譜實(shí)驗(yàn)(PFGE)及指紋圖譜實(shí)驗(yàn)的類(lèi)型:?是;???否???
指紋圖譜實(shí)驗(yàn)的類(lèi)型:????????
1.5是否完成字符實(shí)驗(yàn)(MLST)及字符實(shí)驗(yàn)的類(lèi)型:?是;???否???
字符實(shí)驗(yàn)的類(lèi)型:?????????
1.6是否完成耐藥實(shí)驗(yàn)(MIC)及耐藥實(shí)驗(yàn)的類(lèi)型:?是;???否???
耐藥實(shí)驗(yàn)的類(lèi)型:?????????
1.7是否完成全基因組測(cè)序?qū)嶒?yàn):?是;???否???
1.8是否完成分子分型實(shí)驗(yàn):?是;???否
1.9?是否存在毒力基因及毒力基因名稱(chēng):?+;????—???毒力基因名稱(chēng):????????
1.10血清抗原式:????????
1.11致病性(致瀉性大腸桿菌):??ETEC;??EPEC;??EIEC;??EAEC;??STEC
1.12耐藥類(lèi)型:????????
1.13采樣前是否使用抗生素及抗生素類(lèi)型:??是;???否???抗生素類(lèi)型:????????
1.14是否接種過(guò)相關(guān)菌株的疫苗:???是;???否